ارزیابی روش‌های تشخیص میکروسکوپی و تست تشخیص سریع در مقایسه با تست PCR در تشخیص پلاسمودیوم ویواکس در افراد مشکوک به مالاریا

نوع مقاله : Original Article(s)

نویسندگان

1 دانشجوی کارشناسی ارشد، گروه انگل و قارچ‌شناسی، دانشکده‌ی پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران

2 دکترای تخصصی، گروه ژنتیک و سلولی مولکولی، دانشکده‌ی پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران

3 کارشناس مرکز بهداشت استان اصفهان، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران

4 دکترای تخصصی، گروه انگل و قارچ‌شناسی، دانشکده‌ی پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران

چکیده

مقاله پژوهشی




مقدمه: این مطالعه با هدف بررسی مقایسه‌ای روش تست تشخیص سریع و روش میکروسکوپی با روش (Polymerase chain reaction) PCR در تشخیص پلاسمودیوم ویواکس در بیماران مشکوک به مالاریا طراحی و به اجرا درآمد.
روش‌ها: در یک مطالعه‌ی مقطعی، از تعداد 207 بیمار تب‌دار مشکوک به مالاریا، جهت تشخیص میکروسکوپی، از انگشت هر فرد خون‌گیری و گسترش تهیه و بعد از رنگ‌آمیزی با گیمسا، با عدسی X100 میکروسکوپ نوری، مورد بررسی قرار گرفتند. همچنین از همه‌ی افراد مشکوک، نمونه‌ی خون کامل گرفته شد و تست تشخیص سریع (Rapid diagnostic test) RDT و سپس DNA استخراج و PCR انجام شد. برای بررسی اعتبار روش‌های مختلف، ضمن محاسبه‌ی حساسیت، ویژگی، ارزش اخباری مثبت، ارزش اخباری منفی، رسم منحنی ROC، از ضریب کاپا (к) برای اندازه‌گیری میزان توافق تست‌ها استفاده شد.
یافته‌ها: در این مطالعه، روش میکروسکوپی و RDT نسبت به PCR به ترتیب دارای: حساسیت 96 و 94 درصد و ویژگی 100 و 98/2 درصد می‌باشند. همچنین ضریب کاپا در روش میکروسکوپی، 0/96 و در RDT، 0/91 بدست آمد.
نتیجه‌گیری: با توجه به مقادیر حساسیت و ویژگی، همچنین بالا بودن ضریب کاپا در روش میکروسکوپی و RDT، هر دو روش از میزان توافق خیلی خوب با روش PCR برخوردار بودند.

کلیدواژه‌ها

موضوعات


عنوان مقاله [English]

Comparison of Polymerase Chain Reaction, Microscopy, and Rapid DiagnosticTest in the Detection of Plasmodium Vivax Parasite in Clinically Suspected Malaria Patients

نویسندگان [English]

  • Mahmoud Sadeghi 1
  • Mohammad Kazemi 2
  • Seyed Amirreza Zahirmirdamadi 3
  • Elham Heidari 3
  • Zahra Ghayour Najafabadi 4
1 MSc Student, Department of Parasitology and Mycology, School of Medicine, Isfahan University of Medical Sciences, Isfahan, Iran
2 PhD, Department of Genetic, School of Medicine, Isfahan University of Medical Sciences, Isfahan, Iran
3 Health Vice Chancellery of Isfahan Medical University, Isfahan University of Medical Sciences, Isfahan, Iran
4 PhD, Department of Parasitology and Mycology, School of Medicine, Isfahan University of Medical Sciences, Isfahan, Iran
چکیده [English]

Background: This study was carried out with the aim of evaluating the rapid diagnostic test (RDT) and microscopic method in comparison with PCR in the detection of Plasmodium vivax parasites in suspected malaria cases.
Methods: In a cross-sectional study, out of 207 febrile patients suspected of malaria, for microscopic diagnosis, blood sample was taken from each person's finger and spread, and after staining with Giemsa dye, were examined with a 100 X optical microscope lens. Whole blood samples were collected from all suspected individuals and rapid diagnostic test (RDT), and also DNA extraction and PCR was performed. To check the validity of different methods, the diagnostic performance (sensitivity, specificity, positive predictive value, and negative predictive value), ROC curve and Kappa coefficient (к) of all three methods was compared.
Findings: In this study, microscopy and RDT compared to PCR have sensitivity of 96% and 94% and specificity of 100% and 98.2%, respectively. Also, the kappa coefficient in the microscopic method is 0.96 and the RDT was 0.91.
Conclusion: Considering the values of sensitivity and specificity, as well as the high kappa coefficient in the microscopic method and RDT, both methods have a very good agreement with the PCR.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Malaria
  • PCR
  • RDT
  • Plasmodium vivax
  1. World Health Organization. World malaria report 2022. Geneva, Switzerland: WHO; 2022.
  2. Shahbazi A, Raeisi A, Mirhendi SH, Asgharzadeh M, Sadeghi Bazargani H. Validation of microscopic diagnosis of malaria in field laboratories of malarious areas of Iran by Nested PCR [in Persian]. Hormozgan Med J 2009; 13(3): 166-72.
  3. Basu S, Sahi PK. Malaria: an update. Indian J Pediatr 2017; 84(7): 521-8.
  4. Warrell DA, Gilles HM. Rationale and technique of malaria control. In: Warrell DA, Gilles HM, editors. Essential malariology. Boca Raton, Florida: CRC Press; 2017. p. 107-90.
  5. Berzosa P, de Lucio A, Romay-Barja M, Herrador Z, González V, García L, et al. Comparison of three diagnostic methods (microscopy, RDT, and PCR) for the detection of malaria parasites in representative samples from Equatorial Guinea. Malar J 2018; 17(1): 333.
  6. Siahaan L. Laboratory diagnostics of malaria. Proceeding of the IOP Conference Series: Earth and Environmental Science; 2018 Mar 1; Bristol, England: IOP Publishing.
  7. Fitri LE, Widaningrum T, Endharti AT, Prabowo MH, Winaris N, Nugraha RY. Malaria diagnostic update: From conventional to advanced method. J Clin Lab Anal 2022; 36(4): e24314.
  8. Slater L, Ashraf S, Zahid O, Ali Q, Oneeb M, Akbar MH,et al. Current methods for the detection of Plasmodium parasite species infecting humans. Curr Res Parasitol Vector Borne Dis 2022; 2: 100086.
  9. Viera AJ, Garrett JM. Understanding interobserver agreement: the kappa statistic. Fam Med 2005; 37(5): 360-3.
  10. Shreffler J, Huecker MR. Diagnostic testing accuracy: Sensitivity, specificity, predictive values and likelihood ratios. In: StatPearls [Internet]. Treasure Island (FL): StatPearls Publishing; 2023.
  11. World Health Organization. World Malaria Report
    Geneva, Switzerland: WHO; 2019.
  12. Hommel M. Diagnostic methods in malaria. In: Warrell DA, Gilles HM, editors. Essential malariology. Boca Raton, Florida: CRC Press; 2017. p. 35-58.
  13. Mbanefo A, Kumar N. Evaluation of malaria diagnostic methods as a key for successful control and elimination programs. Trop Med Infect Dis 2020; 5(2): 102.
  14. Rodulfo H, De Donato M, Mora R, González L, Contreras CE. Comparison of the diagnosis of malaria by microscopy, immunochromatography and PCR in endemic areas of Venezuela. Braz J Med Biol Res 2007; 40(4): 535-43.
  15. Das S, Rajkumari N, Revathi U, Gururajan A. Comparision of the various routine diagnostic modalities of malaria and a new method: the Parasight™ platform. J Parasit Dis 2020; 44(3): 528-35.
  16. Zakeri S, Mamaghani S, Mehrizi AA, Shahsavari Z, Raeisi A, Arshi S, et al. Molecular evidence of mixed P. vivax and P. falciparum infections in northern Islamic Republic of Iran. East Mediterr Health J 2004; 10(3): 336-42.
  17. Ebrahimzadeh A, Fouladi B, Fazaeli A. High rate of detection of mixed infections of Plasmodium vivax and Plasmodium falciparum in South-East of Iran, using nested PCR. Parasitol Int 2007; 56(1): 61-4.
  18. Zakeri S, Talebi Najafabadi S, Zare A, Dinparast Djadid N. Detection of malaria parasites by nested PCR in south-eastern, Iran: evidence of highly mixed infections in Chahbahar district. Malar J 2002; 1(1): 2.
  19. Faye B, Nath-Chowdhury M, Tine RC, Ndiaye JL, Sylla K, Camargo FW, et al. Accuracy of HRP2 RDT (Malaria Antigen Pf®) compared to microscopy and PCR for malaria diagnosis in Senegal. Pathog Glob Health 2013; 107(5): 273-8.
  20. Charpentier E, Benichou E, Pagès A, Chauvin P, Fillaux J, Valentin A, et al. Performance evaluation of different strategies based on microscopy techniques, rapid diagnostic test and molecular loop-mediated isothermal amplification assay for the diagnosis of imported malaria. Clin Microbiol Infect 2020; 26(1): 115-21.
  21. Rogier E, Hamre KE, Joseph V, Plucinski MM, Presume J, Romilus I, et al. Conventional and high-sensitivity malaria rapid diagnostic test performance in 2 transmission settings: Haiti 2017. J Infect Dis 2020; 221(5): 786-95.