کاهش بیان ژن PSMB9 در بیماران مبتلا به کارسینوم اندومتر

نوع مقاله : مقاله های پژوهشی

نویسندگان

1 استادیار، گروه زیست‌شناسی سلولی مولکولی و میکروبیولوژی، دانشکده‌ی علوم و فناوری‌های زیستی، دانشگاه اصفهان، اصفهان، ایران

2 دانشجوی کارشناسی ارشد، گروه زیست‌شناسی سلولی مولکولی و میکروبیولوژی، دانشکده‌ی علوم و فناوری‌های زیستی، دانشگاه اصفهان، اصفهان، ایران

3 استاد، گروه زنان و زایمان، دانشکده‌ی پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران

چکیده

مقاله پژوهشی




مقدمه: کارسینوم اندومتر، دومین نئوپلاسم شایع در زنان است و شناخت ژن‌های دخیل در بروز آن می‌تواند به درک رفتارشناسی این بیماری کمک کند و سپس در نحوه‌ی درمان، مؤثر باشد.
روش‌ها: تعداد 35 نمونه بافت تازه منجمد کارسینوم اندومتر و 24 بافت سالم اندومتر مجاور تومور، جمع‌آوری شد. استخراج RNA تام سلولی و سپس تیمار با آنزیم DNaseI، انجام شد. cDNA به کمک پرایمرهای تصادفی شش‌تایی ساخته شد. بیان ژن PSMB9 به کمک پرایمرهای اختصاصی تقاطع اگزون و به روش RT-qPCR سنجیده شد. آنالیز آماری داده‌ها به کمک نرم‌افزار REST2009 انجام شد.
یافته‌ها: مشاهده‌ی دو باند RNA‌های ریبوزومی، خرد نشدن RNA در طی مراحل استخراج را نشان داد. غلظت مناسب RNAهای استخراج شده در محدوده‌ی مناسب برای ساخت cDNA قرار داشت. بررسی منحنی ذوب نشان داد که تکثیر اختصاصی ژن PSMB9 انجام شده است. تفاوت میزان بیان mRNA ژن PSMB9 بین بافت مبتلا به کارسینوم اندومتر و بافت سالم مجاور، معادل 0/266 واحد بود که با توجه به مقدار P برابر با 0/008 معنی‌دار درنظر گرفته شد.
نتیجه‌گیری: کاهش بیان ژن PSMB9 در بافت کارسینوم اندومتر نسبت به بافت سالم مجاور تومور مشاهده شد و این کاهش بیان می‌تواند نشان‌دهنده‌ی نقش سرکوب‌کنندگی تومور برای ژن PSMB9 باشد.

تازه های تحقیق

سید مرتضی جوادی راد: Google Scholar

الهام شیشه بر: Google Scholar

فریبا بهنام فر: Google Scholar

کلیدواژه‌ها

موضوعات

عنوان مقاله [English]

Decreased Expression of PSMB9 Gene in Patients with Endometrial Carcinoma

نویسندگان [English]

  • Seyed Morteza Javadirad 1
  • Elham Shishebor 2
  • Fariba Behnamfar 3
1 Assistant Professor, Department of Cell and Molecular Biology and Microbiology, School of Biological Science and Technology, University of Isfahan, Isfahan, Iran
2 MS Student, Department of Molecular Cell Biology and Microbiology, School of Biological Science and Technology, University of Isfahan, Isfahan, Iran
3 Professor, Department of Obstetrics and Gynecology, School of Medicine, Isfahan University of Medical Sciences, Isfahan, Iran
چکیده [English]

Background: Endometrial carcinoma is the second most common neoplasm in women, and understanding the genes involved in its occurrence can help in understanding the disease behavior and, ultimately, in treating it.
Methods: There were 35 samples of frozen endometrial carcinoma tissues and 24 samples of normal endometrium adjacent to the tumors. Cell total RNA was extracted, followed by DNaseI enzyme treatment. Using random hexamers cDNA was synthesized. We measured PSMB9 gene expression by RT-qPCR using exon junction-specific primers. The statistical analysis was performed using REST2009 software.
Findings: The observation of two ribosomal RNA bands showed that RNA was not broken during extraction. The appropriate concentration of extracted RNA was in the appropriate range for cDNA. Examination of the melting curve showed that specific amplification of the PSMB9 gene was performed. The difference in PSMB9 mRNA expression between endometrial carcinoma tissue and adjacent normal tissue was 0.266 units. This was considered significant according to a P of 0.008.
Conclusion: There was a decrease in PSMB9 gene expression in endometrial carcinoma tissues compared with normal endometrial tissues adjacent to the tumor. The fact that PSMB9 expression has decreased may indicate that the gene has tumor suppressor functions.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Endometrial carcinoma
  • PSMB9
  • Gene
  • Tumor suppressor

مراجع

  1. Miller KD, Nogueira L, Devasia T, Mariotto AB, Yabroff KR, Jemal A, et al. Cancer treatment and survivorship statistics, 2022. CA Cancer J Clin 2022; 72(5): 409-36.
  2. Sung H, Ferlay J, Siegel RL, Laversanne M, Soerjomataram I, Jemal A, et al. Global Cancer Statistics 2020: GLOBOCAN Estimates of Incidence and Mortality Worldwide for 36 Cancers in 185 Countries. CA Cancer J Clin 2021; 71(3): 209-49.
  3. Vizza E, Cutillo G, Bruno V, Sperduti I, Mancini E, Baiocco E, et al. Pattern of recurrence in patients with endometrial cancer: A retrospective study. Eur J Surg Oncol 2020; 46(9): 1697-702.
  4. Rostami S, Nahvijou A. Gynecologic Cancers Estimates in the I.R. Iran, 2012- 2040. Basic Clin Cancer Res 2022; 13(2): 111-8.
  5. Brehm A, Liu Y, Sheikh A, Marrero B, Omoyinmi E, Zhou Q, et al. Additive loss-of-function proteasome subunit mutations in CANDLE/PRAAS patients promote type I IFN production. J Clin Invest 2015; 125(11): 4196-211.
  6. Xu Y, Liu G, Zhou Y, Lu Z, Shi Z, Wang J. The genetic association between LMP2 and LMP7 polymorphisms and susceptibility of insulin dependent diabetes mellitus. Medicine (Baltimore) 2020; 99(13): e19482.
  7. Gergelits V, Parvanov E, Simecek P, Forejt J. Chromosome-wide characterization of meiotic noncrossovers (gene conversions) in mouse hybrids. Genetics 2021; 217(1): 1-14.
  8. Guillon H, de Massy B. An initiation site for meiotic crossing-over and gene conversion in the mouse. Nat Genet 2002; 32(2): 296-9.
  9. Van Kaert L, Ashton-Rickardt PG, Eichelberger M, Gaczynska M, Nagashima K, Rock KL, et al. Altered peptidase and viral-specific T cell response in LMP2 mutant mice. Immunity 1994; 1(7): 533-41.
  10. Del Rio Oliva M, Mellett M, Basler M. Immunoproteasome inhibition attenuates experimental psoriasis. Front Immunol 2022; 13: 1075615.
  11. Xie X, Bi H-L, Lai S, Zhang Y-L, Li N, Cao H-J, et al. The immunoproteasome catalytic β5i subunit regulates cardiac hypertrophy by targeting the autophagy protein ATG5 for degradation. Sci Adv
    2019; 5(5): eaau0495.
  12. Tripathi SC, Vedpathak D, Ostrin EJ. The Functional and Mechanistic Roles of Immunoproteasome Subunits in Cancer. Cells 2021; 10(12): 3587.
  13. Sultana GNN, Akter F, Israfil SMH, Ray UC, Jahan RA, Ali MS, et al. Quantitative analysis of serum cell-free DNA as a predictive and prognostic marker in breast cancer patients. Front Oncol 2023; 13: 1171412.
  14. Adamski MG, Gumann P, Baird AE. A method for quantitative analysis of standard and high-throughput qPCR expression data based on input sample quantity. PLoS One 2014; 9(8): e103917.
  15. Dutta D, Naiyer S, Mansuri S, Soni N, Singh V, Bhat KH, et al. COVID-19 Diagnosis: A Comprehensive Review of the RT-qPCR Method for Detection of SARS-CoV-2. Diagnostics 2022; 12(6): 1503.
  16. Javadirad SM, Mokhtari M, Esfandiarpour G, Kolahdouzan M. The pseudogene problem and RT-qPCR data normalization; SYMPK: a suitable reference gene for papillary thyroid carcinoma. Sci Rep 2020; 10(1): 18408.
  17. Livak KJ, Schmittgen TD. Analysis of relative gene expression data using real-time quantitative PCR and the 2−ΔΔCT method. Methods 2001; 25(4): 402-8.
  18. Hayashi T, Faustman DL. Development of spontaneous uterine tumors in low molecular mass polypeptide-2 knockout mice. Cancer Res 2002; 62(1): 24-7.
  19. Chen B, Zhu H, Yang B, Cao J. The dichotomous role of immunoproteasome in cancer: Friend or foe? Acta Pharm Sin B 2022; 13(5): 1976-89.
  20. Geoffroy K, Araripe Saraiva B, Viens M, Béland D, Bourgeois-Daigneault MC. Increased expression of the immunoproteasome subunits PSMB8 and PSMB9 by cancer cells correlate with better outcomes for triple-negative breast cancers. Sci Rep 2023; 13(1): 2129.
  21. Kalaora S, Lee JS, Barnea E, Levy R, Greenberg P, Alon M, et al. Immunoproteasome expression is associated with better prognosis and response to checkpoint therapies in melanoma. Nat Commun 2020; 11(1): 896.
  22. Van Allen EM, Miao D, Schilling B, Shukla SA, Blank C, Zimmer L, et al. Genomic correlates of response to CTLA-4 blockade in metastatic
    Science (80- ) 2015; 350(6257): 207-11.
  23. Leister H, Luu M, Staudenraus D, Lopez Krol A, Mollenkopf HJ, Sharma A, et al. Pro- and Antitumorigenic Capacity of Immunoproteasomes in Shaping the Tumor Microenvironment. Cancer Immunol Res 2021; 9(6): 682-92.
  24. Hayashi T, Horiuchi A, Sano K, Hiraoka N, Kasai M, Ichimura T, et al. Potential role of LMP2 as tumor-suppressor defines new targets for uterine leiomyosarcoma therapy. Sci Rep 2011; 1(1): 180.
  25. Hayashi T, Kobayashi Y, Kohsaka S, Sano K. The mutation in the ATP-binding region of JAK1, identified in human uterine leiomyosarcomas, results in defective interferon-γ inducibility of TAP1 and LMP2. Oncogene 2006; 25(29): 4016-26.
  26. Hayashi T, Horiuchi A, Sano K, Hiraoka N, Ichimura T, Sudo T, et al. Potential diagnostic biomarkers: differential expression of LMP2/β1i and cyclin B1 in human uterine leiomyosarcoma. Tumori 2014; 100(4): 99e-106e.
مجله دانشکده پزشکی اصفهان
دوره 41، شماره 745
هفته 1، بهمن
بهمن و اسفند 1402
صفحه 1038-1045

فایل ها

سابقه مقاله

  • تاریخ دریافت: 13 شهریور 1402
  • تاریخ پذیرش: 26 دی 1402

هم رسانی

ارجاع به این مقاله

آمار