@article { author = {Nadeali, Zakiyeh and Karimi, Amin and Vallian-Borujeni, Sadeq}, title = {Analysis of Genetic Variation of rs4148326 Marker Located in UGT1A1 Gene Region: An Informative Marker for Molecular Diagnosis of Crigler-Najjar Syndrome}, journal = {Journal of Isfahan Medical School}, volume = {31}, number = {260}, pages = {1821-1828}, year = {2013}, publisher = {Isfahan University of Medical Sciences}, issn = {1027-7595}, eissn = {1735-854X}, doi = {}, abstract = {Background: Crigler-Najjar syndrome is a rare, autosomal recessive disorder characterized by unconjugated, non-hemolytic hyperbilirubinemia. The disease is caused by mutations in the UGT1A1 gene, which result in the decrease or lack of the UGT1A1 enzyme activity and thus, lack of bilirubin conjugation with glucuronic acid. Molecular diagnosis of the syndrome has been essentially based on direct mutation analysis. However, due to a large number of mutations associated with the disease, direct mutation analysis is expensive and time consuming. Alternatively, indirect analysis of mutations using linkage analysis by means of polymorphic markers is proposed. Several polymorphic markers associated with the UGT1A1 gene have been studied.Methods: Using bioinformatic analysis of these markers, the single nucleotide polymorphism (SNP) rs4148326 with the C/T sequence, located at 5' region of the gene was selected. Analysis of the marker was performed by genotyping of 186 unrelated healthy individuals in the Isfahanian population, Iran, using tetra-primer amplification refractory mutation system polymerase chain reaction (Tetra-Primer ARMS PCR) technique. Statistical analysis of the results was performed using the GENEPOP software.Findings: The heterozygosity of rs4148326 the marker was 62.9% and the allele frequency for T and C allele was 66.94% and 33.06%, respectively. Analysis of deviations from Hardy-Weinberg equilibrium demonstrated that the Isfahanian population was in equilibrium (P < 0.001) for rs4148326 locus.Conclusion: The data suggested that rs4148326 could be introduced as an informative marker for molecular diagnosis of Crigler-Najjar syndrome in a representative sample of the Iranian population.}, keywords = {Single Nucleotide Polymorphism,UGT1A1 gene,Crigler-Najjar syndrome,Tetra-primer amplification refractory mutation system polymerase chain reaction}, title_fa = {بررسی تنوع ژنتیکی نشانگر rs4148326 واقع در ناحیه‌ی ژنی UGT1A1: یک نشانگر آگاهی‌دهنده برای تشخیص‌ مولکولی سندرم کریگلر- نجار}, abstract_fa = {مقدمه: سندرم کریگلر- نجار یک بیماری نادر با وراثت اتوزومی مغلوب می‌باشد که با افزایش بیلی‌روبین غیر کونژوگه و غیر همولیتیک شناخته می‌شود. بیماری در اثر جهش در ژن UGT1A1 که باعث فقدان یا کاهش فعالیت آنزیم UGT1A1 و در نتیجه عدم ترکیب بیلی‌روبین با گلوکورونیک اسید می‌گردد، ایجاد می‌شود. تشخیص مولکولی این سندرم مبتنی بر روش بررسی مستقیم جهش‌ها می‌باشد، ولی با توجه به تنوع بالای جهش‌ها و پر هزینه و وقت‌گیر بودن روش مزبور، بررسی غیر مستقیم جهش‌ها و آنالیز پیوستگی با استفاده از نشانگرهای چند شکلی به عنوان روش جایگزین پیشنهاد می‌گردد. نشانگرهای چند شکلی متعددی در ناحیه‌ی ژنی UGT1A1 گزارش شده‌اند.روش‌ها: با بررسی بیوانفورماتیک مارکرهای ناحیه‌ی ژنی UGT1A1، مارکر rs4148326 با توالی C/T، واقع در ناحیه‌ی 5’ این ژن جهت مطالعه در جمعیت ایرانی انتخاب شد. به این منظور نمونه‌ای از افراد سالم جمعیت اصفهان شامل 186 فرد غیر خویشاوند با استفاده از تکنیک Tetra-primer ARMS PCR (Tetra-primer amplification refractory mutation system polymerase chain reaction) تعیین ژنوتیپ شدند. نتایج حاصله با نرم‌افزار GENEPOP از نظر آماری بررسی شدند.یافته‌ها: بر اساس نتایج به دست آمده، فراوانی هتروزیگوسیتی نشانگر rs4148326، 9/62 درصد و فراوانی آللی آن برای آلل T و C به ترتیب 94/66 درصد و 06/33 درصد بود. بررسی تعادل ‌هاردی- وینبرگ (Hardy weinberg equilibrium یا HWE) نیز نشان داد که جمعیت اصفهان برای نشانگر rs4148326 در تعادل بود.نتیجه‌گیری: نتایج به دست‌آمده در این مطالعه نشانگر rs4148326 را در نمونه‌ای از جمعیت ایرانی به عنوان یک نشانگر آگاهی‌دهنده در تشخیص‌های مولکولی سندرم کریگلر- نجار به روش آنالیز پیوستگی معرفی می‌نماید. }, keywords_fa = {چندشکلی تک نوکلئوتیدی,UGT1A1,سندرم کریگلر- نجار,Tetra-primer ARMS PCR}, url = {https://jims.mui.ac.ir/article_14189.html}, eprint = {https://jims.mui.ac.ir/article_14189_a9359c700732792ce04ec6ad7567c06b.pdf} }